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Nature:测序揭示转移性肿瘤有何大不同

2017-08-07 11:18:17   来源:生物通   责任编辑:吴楚   字号:T | T

美国密歇根大学的研究人员近期对500例的转移性肿瘤开展全外显子组和全转录组测序,发现它们带有的突变比原发性肿瘤更多。这项成果于8月2日发布在《Nature》杂志上。

同时,研究人员还发现,相当一部分癌症转移的患者带有生殖系突变,这增加了他们的癌症风险。此外,他们指出,转移性肿瘤可根据其mRNA表达谱分成两组,而这些亚型似乎与肿瘤对治疗的反应有关。

这篇文章的通讯作者、密歇根大学的Arul Chinnaiyan表示:“我们的研究结果强调了对转移性肿瘤进行新鲜活检的重要性。在转移和治疗的过程中,肿瘤也在不断发展。我们需要对转移性肿瘤进行活检,然后提出治疗方法,而不是使用原发性肿瘤的存档组织。”

研究团队对500名转移性癌症患者的活检样本和生殖系DNA进行测序,这些样本代表20种癌症,最常见的是转移性前列腺癌、乳腺癌和软组织肉瘤。最频繁的转移灶是肝、淋巴结、肺和骨。

平均而言,研究人员在每位患者中观察到119个体细胞突变,与大多数癌症的原发性肿瘤相比,突变的数量明显增加。他们将这种增加归因于癌症的侵袭性,累积突变的时间延长,以及治疗的影响。

不过,尽管突变的数量增加,但研究人员发现,只有少数基因以高频率突变。大多数时候,这些突变集中在抑癌基因TP53、CDKN2A、PTEN和RB1,或癌基因PIK3CA、AR和KRAS。

Chinnaiyan及其同事也调查了这些患者的致病性生殖系突变。他们发现,12%的患者带有可能致病的遗传突变。最终,他们定位到63个可能致病的生殖系突变。三分之二的突变位于参与DNA修复的基因,如MUTYH、BRCA2、CHEK2和BRCA1。

他们将这些突变的频率与外显子整合联盟(ExAC)的数据集进行比较,发现此次分析的队列人群更有可能携带致病的生殖系突变。

与此同时,研究人员也分析了这些转移性癌症患者的转录组。他们发现,与癌症相关的转录程序增加。与正常组织相比,转移性肿瘤的增殖、应激反应和代谢增加。同时,他们将肿瘤分成两个亚型,一个是与炎症相关,另一个与增殖相关。

“并非所有的转移都是相同的,”Chinnaiyan谈道。“不同通路的推动,让它们彼此完全不同,有些是高度增殖,有些则倾向于分化。这种互相排斥的现象是一个新发现,有望指导我们开发出新型的疗法。”(生物通 薄荷)

[责任编辑:吴楚]

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